ويقوم المركز بادارة والاشراف على برنامج الرقابة النوعية الخارجية بالتعاون مع وزارة الصحة ونقابة الطب المخبري. حيث يتم ذلك من خلال اللجنة التوجيهية والعلمية للبرنامج، وتضم هذه اللجان أيضا في عضويتها ممثلين عن المؤسسات الصحية الأخرى المشاركة في البرنامج.

ويقوم المركز بإدارة برنامج التعليم المستمر بالتعاون مع دائرة العلوم الطبية المخبرية في كلية المهن الصحية - جامعة القدس، وتضم الدائرة نخبة من الأكاديميين المؤهلين للقيام بهذه البرامج حيث يمتلكون خبرات فريدة في مجالات العلوم الطبية المخبرية المختلفة مثل علم الدم وبنك الدم والأحياء الدقيقة والطفيليات والكيمياء السريرية وفحوصات الأمراض الجينية وغيرها.